Должность: Scientist II, Antibody Engineering and Characterization
Местоположение: Сан-Карлос / Офис
Вознаграждение: $126 000 - $182 000 в год
В Nautilus у нас есть большая и важная миссия: улучшить здоровье миллионов людей, раскрыв потенциал протеома для ускорения разработки лекарств и создания нового мира прецизионной и персонализированной медицины. Мы разрабатываем платформу для анализа белков на уровне одиночных молекул с беспрецедентной чувствительностью, масштабом и простотой использования, которая, по нашему мнению, демократизирует доступ к протеому — одному из самых динамичных и ценных источников биологической информации. Для достижения этой цели мы решаем сложные научные задачи с предпринимательским мышлением и создаем команду мирового уровня из новаторов, инженеров и мечтателей из самых разных областей.
Область деятельности и обязанности
Мы ищем специалиста уровня Scientist II, Antibody Engineering & Characterization, который присоединится к нашей растущей команде. Эта роль будет направлена на разработку и характеристику антител-зондов, которые являются центральными для нашей платформы протеомики на уровне одиночных молекул. Scientist II будет отвечать за характеристику антител, генерируя данные, которые определяют, какие кандидаты продвигаются дальше. Помимо поддержания темпа быстро растущего конвейера зондов, этот специалист будет применять механистические исследования и характеризацию связывания для улучшения циклов открытия зондов. Они будут интегрировать последовательные, структурные и биофизические данные для выявления свойств, которые предсказывают производительность на платформе, и превратят эти знания в правила рационального проектирования. Работая на стыке практической инженерии белков и дизайна in silico, они будут формировать нашу стратегию созревания аффинности и способствовать успеху платформы Nautilus.
- Применение стратегий инженерии белков, открытия антител и созревания аффинности для разработки вариантов антител с улучшенной аффинностью связывания
- Проведение очистки, скрининга и характеризации антител (например, BLI, SPR, DSF, SEC/SEC-MALS, Simple Western, ELISA и т. д.) для валидации результатов инженерии антител
- Идентификация, оценка и внедрение новых технологий и методов для характеризации и оценки эффективности антител
- Применение AI/ML и инструментов in silico (например, белковые языковые модели, генеративный дизайн, предсказание структуры) для руководства процессом созревания аффинности антител: генерация и приоритизация вариантов, преобразование выходных данных модели в тестируемые наборы вариантов, и подача экспериментальных данных о связывании и стабильности обратно в модели для управления итеративными циклами дизайна-сборки-тестирования-обучения в партнерстве с командами вычислительной биологии и биоинформатики
- Координация/проведение скрининга антител на платформе Nautilus, анализ и интерпретация результатов, а также интеграция производительности на платформе с данными характеризации вне платформы
- Четкая интерпретация и представление данных, перевод сложных результатов в действенные рекомендации, которые информируют о приоритизации и принятии решений о продолжении/прекращении проекта
- Тесное сотрудничество с командами биоинформатики, вычислительной биологии, открытия и разработки анализов для формулирования гипотез, приоритетов экспериментов и критериев успеха, а также для продвижения антител по конвейеру
- Вклад в экспериментальную стратегию и планирование проектов, проактивное выявление рисков, предложение альтернативных подходов и адаптация планов по мере появления новых данных
- Представление результатов на совещаниях и документирование методов, результатов и выводов в ясной, воспроизводимой форме (например, электронный лабораторный журнал, технические отчеты)
- Содействие созданию совместной среды обмена знаниями путем предоставления научных рекомендаций коллегам, обмена передовыми практиками.
Квалификация
- Прямой опыт характеризации антител и белок-белковых взаимодействий с использованием BLI, SPR, Western blot, ELISA и/или других биофизических методов. Желателен опыт измерения связывания антител с короткими линейными пептидами или эпитопами. Практический опыт разработки, отладки и точной настройки анализов с использованием нескольких технологий, таких как SPR, BLI, ELISA, Westen blot и т. д.
- Опыт инженерии белков с использованием структурной или вычислительной информации для проектирования и тестирования вариантов антител (например, рациональный мутагенез, инженерия аффинности)
- Опыт работы с инструментами предсказания структуры и моделирования
- PhD в области инженерии белков, структурной биологии, биохимии или смежных областях + 2-3 года соответствующего опыта в промышленности
Предпочтительная квалификация
- Опыт применения AI/ML или вычислительных методов (например, белковые языковые модели, генеративный дизайн, глубокое обучение на основе структур) для руководства процессом созревания аффинности антител и преобразования выходных данных модели в тестируемые конструкции вариантов
- Знакомство с Python и ML-фреймворками или конвейерами вычислительной структурной биологии
- Знакомство с платформами для открытия антител (например, фаговый дисплей, дрожжевой дисплей, рибосомный дисплей)
- Опыт работы с платформами протеомики
Культура команды Nautilus
- Мы полны решимости сделать все необходимое, чтобы наша платформа попала в руки исследователей, которые используют ее, чтобы изменить статус-кво в фундаментальных исследованиях и здравоохранении.
- Мы работаем в кросс-функциональных командах, выполняем множество задач, идем на риск, работая в условиях неопределенности, наслаждаемся совместной работой над сложными проблемами и отмечаем победы друг друга.
- Мы выходим за рамки обычного, но также стремимся обеспечить поддерживающую атмосферу коллег, готовых протянуть руку помощи и сделать работу в Nautilus не только плодотворной в достижении конечных целей, но и приятной изо дня в день.
Наши ценности:
- Будьте превосходны
- Будьте хорошим человеком
- Способствуйте успеху клиентов
- Мечтайте по-крупному
- Стремитесь к результатам
- Наслаждайтесь путешествием
- Преуспевайте как единая команда
