Senior Bioinformatics Scientist

Заголовок: Старший научный сотрудник в области биоинформатики Местоположение: Сан-Карлос / Гибридный формат

Компенсация: $126K - $182K в год

В Nautilus у нас есть большая и важная миссия: положительно влиять на здоровье и жизнь людей по всему миру, раскрывая потенциал протеома. Мы разрабатываем платформу для анализа белков на уровне отдельных молекул с беспрецедентной чувствительностью, масштабом и простотой использования, которая, по нашему мнению, демократизирует доступ к протеому – одному из самых динамичных и ценных источников биологических знаний. Для достижения этой цели мы решаем сложные научные задачи с предпринимательским подходом и создаем команду мирового класса из новаторов, изобретателей и мечтателей в широком спектре дисциплин.

Мы активно ищем талантливого старшего научного сотрудника в области биоинформатики для присоединения к нашей растущей команде. Мы разрабатываем новый тип анализа на нашей платформе, и его успех зависит от тесной итерации между лабораторией и данными. В этой роли вы будете полностью отвечать за аналитическую часть этой работы: ежедневно сотрудничать с экспериментаторами для устранения неполадок и оптимизации протоколов, анализировать все типы данных, которые производит платформа, объяснять значение результатов и рекомендовать, что попробовать дальше. Вы также создадите конвейер для этого нового типа данных и будете работать с руководством отдела исследований и разработок над формированием выводов. Мы ищем прикладного, практического ученого, который добивается результатов – того, кто ценит прогресс выше совершенства, не боится погружаться в незнакомую область, устраняет препятствия, не дожидаясь указаний, и является партнером, с которым экспериментальная команда с удовольствием работает.

Эта должность будет подчиняться научному сотруднику в области биоинформатики. Эта должность находится в Сан-Карлос, Калифорния. Требуется минимум три дня работы в офисе.

Обязанности

• Совместная работа с экспериментаторами над разработкой и оптимизацией нового формата анализа, включая проектирование экспериментов, выбор условий для варьирования, определение показателей, определяющих успех, и рекомендации по дальнейшим действиям на основе результатов.

• Устранение неполадок в протоколах путем формирования и тестирования гипотез, охватывающих подготовку образцов, реагенты, флюидику, визуализацию и обработку данных.

• Анализ и интеграция данных из всех режимов, которые производит платформа, включая изображения, показания флюидики, сигналы флуоресценции и декодированные выходные данные отдельных молекул.

• Ответственность за интерпретацию результатов – что означают данные, насколько мы можем быть уверены и что делать дальше – и работа с руководством отдела исследований и разработок над формированием выводов, сообщением о прогрессе и рисках, а также информированием о направлении проекта.

• Проектирование и создание надежного аналитического конвейера, метрик контроля качества и панелей мониторинга для этого нового типа данных, балансируя между быстрыми разовыми анализами и протестированными, многократно используемыми инструментами, которые может запускать вся команда.

• Работа с командой биоинформатиков над разработкой новых аналитических и статистических подходов для интерпретации стохастических измерений отдельных молекул.

• Быстрое обучение поиску и доступу к данным анализа, где бы они ни находились, включая облачные базы данных, объектное хранилище, локальные файловые серверы и необработанные выходные данные приборов, написание кода для разбора метаданных приборов и управление облачным доступом по мере необходимости.

Требования

• Степень PhD в области биоинформатики, вычислительной биологии, биофизики, биохимии, биостатистики или смежной количественной области.

• Минимум 4 года опыта работы в отрасли.

• Опыт работы в качестве прикладного, практического ученого, который добивается результатов: комфортно справляется с прогрессом при неполной информации, погружается в незнакомую область и устраняет препятствия.

• Практический опыт анализа данных лабораторных экспериментов с подтвержденным опытом разработки или оптимизации анализов в тесном сотрудничестве с экспериментальными группами.

• Подтвержденная способность полностью руководить проектом от начала до конца, от экспериментального дизайна и анализа до интерпретации и рекомендаций.

• Исключительные письменные и устные коммуникативные навыки, включая способность представлять результаты руководству и объяснять технические выводы аудитории, не являющейся специалистами в области вычислений.

• Прочная основа в прикладной статистике, включая распределения и изменчивость, проверку гипотез и дизайн экспериментов.

• Владение Python (например, pandas, NumPy, SciPy) и SQL, с опытом создания как надежных конвейеров и панелей мониторинга, так и быстрых разовых анализов.

• Комфортное владение работой с локальными машинами, общими серверами и облачными средами (например, AWS), включая Linux, Git и управление учетными данными доступа.

• Способность вносить вклад в организованную и динамичную команду в быстро меняющейся среде.

• Практический опыт работы в лаборатории является большим преимуществом.

• Опыт работы с протеомикой, флуоресцентной визуализацией, методами анализа отдельных молекул, разработкой приборов или аффинными реагентами является предпочтительным.

• Опыт работы с вероятностным моделированием стохастических данных или моделированием структуры белков является предпочтительным.

Культура команды Nautilus

• Мы любознательные энтузиасты: это команда людей, которые учатся на протяжении всей жизни, не боятся браться за большие задачи и принимают вызовы.

• Мы ориентированы на детали: мы проводим отличные научные исследования, работая умно и усердно, извлекая уроки из наших попыток и ошибок.

• Нам легко работать вместе: мы хотим, чтобы наше рабочее место было таким, где каждый может поделиться своей точкой зрения и относиться с уважением и добротой.