Bioinformatician-developer

Мы Basis Genomic Group — современная биомедицинская компания. Наша цель — стать №1 на рынке персонализированной медицины и удалённой диагностики.

Мы помогаем врачам видеть каждого пациента уникальным, рассматривая все сферы здоровья пациента. Для этого мы создали специальный инструмент диагностики (ДНК-исследования) для врачей разных специальностей. Сейчас мы в поисках биоинформатика-разработчика!

ЗАДАЧИ, КОТОРЫЕ БУДУТ ПЕРЕД ТОБОЙ СТОЯТЬ:

1. Миграция базы знаний из Excel (первые 3–6 месяцев):

• довести до конца инструмент на Python по извлечению базы знаний (реестр признаков, вклады, пороги, тексты, классификация ~34 тыс. формул)
• разобрать совместно с генетиком ~350 особых правил: условия по полу, комбинации генов, мультипликативная модель, X-сцепление
• устранить дубли и противоречия в знаниях, продублированных по 18 панелям
• сформировать базу знаний версии 1.

2. Эталонный расчёт и регрессионные тесты:

• написать на Python эталонный движок интерпретации по извлечённым таблицам
• прогнать тестовые и архивные образцы, добиться совпадения с Excel по каждому из 180 признаков
• использовать тот же набор тестов для валидации промышленного движка на Kotlin.

3. Приём генотипов от лаборатории:

• работа с форматами данных, контроль качества
• ориентация аллелей и цепи, no-call, гемизиготность у мужчин
• сборки генома, сопоставление rsID и HGVS.

4. Ведение базы знаний совместно с генетиком:

• аннотация вариантов: частоты, ClinVar, PharmGKB, CPIC для фармакогенетики
• оценка доказательности связей и выбор модели риска для каждого признака

5. Перспективные задачи:

• быстрый запуск новых панелей
• подготовка к зарубежным рынкам (популяционные частоты, стандарты)
• полигенные шкалы, аналитика по накопленным данным.

НАМ ВАЖНО, ЧТОБЫ У ТЕБЯ БЫЛИ:

• понимание генетики: полиморфизмы, генотипы, наследование, фармакогенетика
• промышленная разработка на Python: чистый код, тесты, воспроизводимость
• опыт работы с биологическими/генетическими данными (аннотация вариантов, rsID, HGVS, сборки генома)
• умение работать с базами знаний: ClinVar, PharmGKB, CPIC, популяционные частоты
• способность быть мостом между генетиком и разработкой: переводить предметную логику в данные и алгоритмы.

Будет плюсом:

• опыт миграции знаний из Excel/legacy-систем в структурированные базы данных
• знакомство с Kotlin или готовность изучить и начать работу с ним
• понимание статистических моделей оценки риска (аддитивная, мультипликативная, полигенные шкалы)
• опыт построения регрессионных тестов и эталонных движков.

Не подойдёт:

• чистый исследователь без опыта промышленной разработки
• чистый программист без понимания генетики.

Продукт: Унисон — платформа персонализированной интерпретации генетических тестов и анализов. Выходим на рынки России, Казахстана и международный.

ЧТО МЫ ПРЕДЛАГАЕМ:

• Официальное трудоустройство по ТК РФ
• Полностью белую заработную плату
• График работы: 5/2 с 9:00–18:00, СБ и ВС — выходные
• Гибридный формат работы или удалённый — по договорённости
• Оплачиваемый 28-дневный отпуск с возможностью разбивки по году в удобном для себя формате и оплачиваемые больничные
• Современную рабочую технику и все необходимые ресурсы для комфортной работы
• Планы развития компетенций и дополнительные обучения, которые предлагаются индивидуально по потребностям
• Внутренние скидки на продукты группы компаний
• Классные корпоративные мероприятия: выезд на природу в лучшие отели Алтая и других местностей, выезд зимой на покатушки в горы, участие в Гонке Героев, квизы, совместные прогулки на снегоходах и прочие забавы полностью за счёт компании (трансфер, проживание, напитки и программы)
• Призы и подарки на дни рождения, памятные даты (годовщина работы в компании и т. д.)
• Амбициозная и заряженная на результат команда
• Возможность дополнительного дохода внутри Группы компаний путём выполнения дополнительных проектов в разных сферах!

Уважаемые соискатели!

Мы можем бесконечно писать о нас. Откликайтесь — мы расскажем всё лично!