Senior Staff Bioinformatics Scientist (AI-guided protein engineering)

Заголовок: Старший научный сотрудник по биоинформатике (инженерия белков с помощью ИИ) Местоположение: Сингапур - Вудлендс - Норткост

Местоположение: Сингапур - Вудлендс - Норткост Занятость: Полный рабочий день Что, если работа, которую вы делаете каждый день, может повлиять на жизнь людей, которых вы знаете? Или на все человечество? В Illumina мы расширяем доступ к геномным технологиям для обеспечения равенства в области здравоохранения для миллиардов людей по всему миру. Наши усилия позволяют совершать жизненно важные открытия, которые трансформируют здоровье человека благодаря раннему выявлению и диагностике заболеваний, а также новым вариантам лечения для пациентов. Работа в Illumina означает причастность к чему-то большему, чем вы сами. Каждый человек, на любой должности, имеет возможность изменить ситуацию. В окружении выдающихся людей, вдохновляющих лидеров и проектов, меняющих мир, вы сделаете больше и станете больше, чем когда-либо думали, что возможно. Почему мы? Illumina является мировым лидером в области технологий секвенирования следующего поколения (NGS). Благодаря неустанным инновациям Illumina снизила стоимость секвенирования человеческого генома с сотен тысяч долларов до менее чем 200 долларов. Резкое снижение стоимости позволило перенести NGS из лаборатории в клинику, что оказало широкое влияние от диагностики рака до генетического тестирования. Мы приглашаем вас присоединиться к нам в наших усилиях по улучшению здоровья человека, используя возможности генома. Краткое описание должности Мы ищем старшего научного сотрудника, который поможет в создании вычислительных инструментов и информационной базы данных для нашей группы по инженерии белков в рамках глобальных программ по инженерии ферментов. Эта роль будет связывать структуры данных для высокопроизводительного и среднепроизводительного скрининга, участвовать в разработке и оценке методов, а также помогать в создании полузамкнутых и замкнутых рабочих процессов проектирования-создания-тестирования-обучения. Успешный кандидат будет обеспечивать старшее техническое руководство на стыке инженерии белков, проектирования с помощью ИИ/МО, систем скрининговых данных, автоматизации и экспериментального выполнения. Этот ученый определит, как результаты скрининга становятся повторно используемыми активами данных, а также как вычислительные методы оцениваются и внедряются. Эта должность находится в Сингапуре. Это прекрасная возможность стать частью продолжающегося роста Illumina. Обязанности включают, но не ограничиваются: Создание повторно используемых баз данных для инженерии белков. Определение структур данных, стандартов метаданных, линии происхождения вариантов, контекста анализа, контролей, обработки повторов, неопределенности и сбора отрицательных данных в рабочих процессах высокопроизводительного и среднепроизводительного скрининга. Обеспечение инженерии ферментов на основе моделей. Разработка и оценка вычислительных рабочих процессов, которые связывают наборы данных последовательностей, структур, анализов и скрининга с моделями ИИ/МО, обоснованием проектирования, приоритизацией вариантов и дизайном библиотек следующего раунда. Оценка вычислительных методов и методов ИИ. Оценка внутренних конвейеров, методов с открытым исходным кодом, коммерческих платформ проектирования белков и новых научных агентов с использованием ретроспективных и проспективных метрик производительности, относящихся к программам инженерии ферментов. Предоставление практических инструментов для проектных групп. Создание повторно используемых скриптов, шаблонов, панелей мониторинга, легких приложений и конвейеров анализа, которые помогают экспериментальным и вычислительным группам выполнять рутинный анализ и эффективно интерпретировать рекомендации. Продвижение рабочих процессов замкнутого цикла DBTL. Помощь в создании полузамкнутых и замкнутых систем проектирования-создания-тестирования-обучения, в которых экспериментальные результаты собираются, анализируются, моделируются, рецензируются и преобразуются в действенные рекомендации по проектированию. Сотрудничество в рамках глобальных инженерных программ. Тесное сотрудничество с учеными-экспериментаторами, группами автоматизации, информатикой, разработкой программного обеспечения, инженерией данных, химиками, биофизиками и командными платформами для обеспечения соответствия вычислительных рабочих процессов пропускной способности анализа, операционным ограничениям и целям программы. Все перечисленные задачи и обязанности считаются неотъемлемыми функциями данной должности; однако деловые условия могут потребовать разумных приспособлений для выполнения дополнительных задач и обязанностей. Требуемое образование, опыт и атрибуты: докторская степень в области вычислительной химии, вычислительной биологии, биоинформатики, информатики или смежных областях, или эквивалентный опыт работы и образования. Значительный опыт руководства проектами в области вычислительной биологии, инженерии белков, ИИ/МО, аналитики скрининга или инфраструктуры научных данных. Глубокий опыт применения вычислительных или основанных на данных методов в инженерии белков, инженерии ферментов, направленной эволюции, анализе анализов или смежных задачах проектирования биологических систем. Подтвержденная способность проектировать структуры данных или аналитические системы, поддерживающие воспроизводимый анализ, обучение моделей и межпроектное обучение. Опыт работы в лаборатории в области высокопроизводительного или среднепроизводительного скрининга и/или проектирования биохимических анализов. Прочные навыки программирования хотя бы на одном из основных языков программирования (например, C/C++, Python, R). Глубокое знание моделирования последовательностей или структур белков, прогнозирования взаимодействия белок-лиганд и/или молекулярных симуляций. Понимание методов ИИ/МО и практический опыт внедрения моделей проектирования белков на основе ИИ/МО. Сильные базовые знания в области статистического моделирования, проектирования алгоритмов, анализа данных и/или методов визуализации. Отличные навыки устного и письменного общения. Командный игрок, открытый и самосознательный, способный быстро интегрироваться в кросс-функциональные команды. Высоко мотивированный человек с доказанной способностью к инновационному мышлению и подтвержденным опытом продуктивных исследований и разработок. Сильные кандидаты с меньшим опытом будут рассмотрены для позиции, соответствующей их опыту. Предпочтительный опыт и атрибуты: Опыт работы с фундаментальными моделями ИИ/МО и белковыми языковыми моделями для инженерии белков, включая генеративное проектирование белков, оценку вариантов методом нулевого выстрела, обучение с учителем, проектирование библиотек на основе моделей, обучение с учетом шума и неопределенности, а также многопараметрическую оптимизацию свойств белков. Опыт прогнозирования структур, моделирования белок-лиганд или фермент-субстрат, молекулярной динамики, докинга или биофизического анализа (например, Protein MPNN, RFdiffusion, Boltz, Alphafold). Опыт разработки стандартов данных, схем анализов, панелей мониторинга или легких инструментов для ученых-экспериментаторов. Опыт разработки ИИ-агентов и агентских рабочих процессов для разработки методов и приложений, а также автоматического выполнения и оптимизации вычислительных конвейеров. Фреймворки глубокого обучения, такие как PyTorch, TensorFlow или JAX. Анализ больших биологических данных с использованием облачных сред или сред высокопроизводительных вычислений. Практический опыт разработки моделей ИИ/МО для проектирования белков. Опыт экспериментов в области инженерии белков, например, направленной эволюции, высокопроизводительного скрининга. Опыт использования одного или нескольких общепринятых программ для молекулярного моделирования, например, Rosetta. Знание лучших практик разработки программного обеспечения и контроля версий кода, например, Git. Знание среды UNIX и скриптовых оболочек. Опыт работы с высокопроизводительными вычислениями, планировщиками заданий и/или вычислениями на GPU. Широкие знания баз данных, инструментов и/или алгоритмов в области биоинформатики, геномики и/или протеомики. Знания в области биохимии, энзимологии и/или молекулярной биологии. Знакомство с технологиями, инструментами и/или рабочими процессами секвенирования следующего поколения. Мы — компания, глубоко укоренившаяся в культуре принадлежности, способствующая созданию инклюзивной среды, где сотрудники чувствуют себя ценными и имеют возможность внести свой вклад в нашу миссию. Основанная на прочном фундаменте, Illumina всегда уделяла приоритетное внимание открытости, сотрудничеству и поиску альтернативных точек зрения для продвижения инноваций в геномике. Мы с гордостью подтверждаем нулевой разрыв в оплате труда, независимо от пола, этнической принадлежности или расы. У нас также есть несколько групп поддержки сотрудников (ERG), которые предоставляют возможности для карьерного развития, повышают культурную осведомленность и предлагают возможности для участия в социальной ответственности. Мы гордимся тем, что являемся работодателем, предоставляющим равные возможности, и стремимся предоставлять рабочие места независимо от пола, расы, вероисповедания, цвета кожи, гендера, религии, семейного положения, статуса партнера в гражданском браке, возраста, национального происхождения или происхождения, физических или умственных недостатков, медицинского состояния, сексуальной ориентации, беременности, статуса военнослужащего или ветерана, гражданства и генетической информации. Illumina проводит проверку биографических данных кандидатов, которым было сделано условное предложение о работе. Квалифицированные кандидаты с судимостью или обвинительным приговором будут рассматриваться для трудоустройства в соответствии с применимыми местными, государственными и федеральными законами. Результаты проверки биографических данных могут потенциально привести к отзыву условного предложения о работе. Процесс проверки биографических данных и любые решения, принятые в результате, будут осуществляться в соответствии со всеми применимыми местными, государственными и федеральными законами. Illumina запрещает использование генеративного искусственного интеллекта (ИИ) в процессе подачи заявок и собеседований. Если вам требуется помощь в заполнении заявки или прохождении собеседования, свяжитесь с контакт рекрутера. Узнайте больше по адресу: Вакансия будет открыта до выбора окончательного кандидата или до тех пор, пока по заявке не будет достаточно квалифицированных кандидатов.