Senior / Principal Data Infrastructure Engineer

Название: Ведущий / Главный инженер по инфраструктуре данных Местоположение: Expedition Medicines / Кембридж, Массачусетс, США

Что если… вы могли бы присоединиться к организации, которая создает, финансирует и развивает биотехнологические компании, разрабатывающие прорывные технологии для трансформации здравоохранения и устойчивого развития?

О Expedition:

Expedition Medicines — это частная биотехнологическая компания на ранней стадии развития, которая является пионером в новой области редактирования белков. В Expedition Medicines мы создаем низкомолекулярные соединения, которые редактируют структуру и функцию белков, чтобы получить доступ к в настоящее время недоступным мишеням и использовать широкий спектр терапевтических модальностей. Наша платформа интегрирует новейшие технологии химии низкомолекулярных соединений и хемопротеомики с машинным обучением (ML) для генеративного проектирования. Expedition Medicines поддерживается Flagship Pioneering, которая предоставляет свою смелость, видение и ресурсы для направления Expedition Medicines от валидации платформы до воздействия на пациентов. Мы ищем страстных к оказанию влияния, готовых к сотрудничеству и неустанно решающих проблемы людей, чтобы присоединиться к нам!

Краткое описание вакансии:

Мы ищем высококвалифицированного, практического ведущего / главного инженера по инфраструктуре данных для проектирования, создания и владения системами данных, которые делают наши протеомные данные обнаруживаемыми, надежными и пригодными для использования во всей организации. Expedition Medicines разрабатывает инструменты машинного обучения, обученные на протеомных данных, генерируемых нашей экспериментальной платформой, и эта роль имеет решающее значение для надежного, масштабируемого сбора, управления и анализа этих данных в большом объеме.

Это роль ведущего индивидуального контрибьютора для инженера, который пишет код, внедряет системы и определяет техническое направление. Вы будете работать самостоятельно, с четким видением того, куда должна двигаться наша инфраструктура данных, и вы воплотите это видение в рабочие системы производственного качества, на которые ежедневно полагаются ученые-ML, медицинские химики и группы биологов.

Обязанности:

• Архитектура и создание: Проектирование и внедрение основной платформы данных, которая интегрирует экспериментальные протеомные данные с вычислительными инструментами, с высокой доступностью, масштабируемостью и безопасностью. Написание производственного кода.
• Владение техническим видением: Определение и продвижение технической дорожной карты для инфраструктуры данных, выявление проблем с наибольшим потенциалом воздействия.
• Автоматизация и интеграция: Создание автоматизированных рабочих процессов в средах протеомных исследований, включая высокопроизводительные анализы и обработку данных масс-спектрометрии. Интеграция приборов, конвейеров и LIMS (например, Dotmatics) для бесшовного, прослеживаемого сбора данных.
• Конвейеры данных: Разработка и эксплуатация надежных конвейеров данных с использованием инструментов оркестровки рабочих процессов (например, Flyte), а также проектирование многоуровневых архитектур данных (например, стиля medallion), надежно и воспроизводимо преобразующих необработанные выходные данные приборов в наборы данных, готовые для ML.
• Облачная инфраструктура: Проектирование, развертывание и обслуживание облачной инфраструктуры для обработки, хранения и анализа биологических и протеомных данных с использованием подхода «инфраструктура как код» (IaC) и CI/CD для обеспечения постоянного улучшения систем данных.
• Целостность и качество данных: Установление и внедрение строгих стандартов целостности, происхождения, прослеживаемости и согласованности данных. Создание инструментария, обеспечивающего соблюдение передовых практик сбора, хранения и обмена данными в ручных и автоматизированных рабочих процессах.
• Партнерство с учеными: Прямое взаимодействие с нашими командами по протеомике, химии, биологии и машинному обучению для преобразования научных целей в решения для инфраструктуры данных. Быть основным техническим экспертом по системам данных.
• Инженерные практики: Установление инженерных стандартов посредством обзора кода, обзора дизайна и примеров. Неформальное наставничество инженеров и ученых и обмен знаниями.

Квалификация:

• Степень бакалавра в области компьютерных наук, инженерии данных, вычислительной биологии, протеомики или смежной технической области; ученая степень является плюсом.
• 8+ лет практического опыта в области инфраструктуры данных, инженерии данных, информатики или смежных областях, предпочтительно в протеомике, биоинформатике или других биотехнологических средах.
• Подтвержденный опыт самостоятельного проектирования, создания и эксплуатации систем данных объемом в терабайты в биотехнологической или медико-биологической среде.
• Подтвержденная способность определять техническое направление и выполнять сложные проекты при минимальном контроле.
• Опыт работы с облачной инфраструктурой (например, AWS, Azure), Kubernetes и инструментами управления инфраструктурой как кодом (CFN, CDK, Terraform, ARM).
• Глубокое понимание и опыт моделирования данных с использованием систем баз данных и хранилищ данных (например, Postgres, Redshift, Snowflake). Хорошее знакомство с архитектурами lakehouse и стиля medallion (например, Delta Lake, Iceberg).
• Опыт в области архитектуры конвейеров данных и оркестровки рабочих процессов (например, Flyte, Dagster, Airflow), включая API, планировщики и интеграцию программного обеспечения.
• Высокая квалификация в Python, SQL; уверенное владение R.
• Практический опыт работы с DevOps, жизненным циклом разработки программного обеспечения (SDLC) и инструментами автоматизации (например, Terraform) и практиками CI/CD.
• Отличные письменные и устные коммуникативные навыки, способность объяснять технические решения как техническим, так и нетехническим коллегам.

Предпочтительно:

• Настоятельно приветствуется опыт использования LLM и инструментов, основанных на агентах (например, Claude, серверы протокола Model Context), для создания интерактивных интерфейсов запросов на естественном языке, которые предоставляют научным группам прямой доступ к данным.
• Опыт работы с данными масс-спектрометрии и/или NGS, а также с рабочими процессами обнаружения биомаркеров.
• Опыт работы с LIMS и системами управления данными (например, Dotmatics, CORE LIMS).
• Знакомство с системами лабораторной автоматизации, включая интеграцию с платформами управления робототехникой и образцами.

О Flagship:

Flagship Pioneering — это компания, специализирующаяся на инновационных биотехнологических платформах, которая создает и развивает платформенные компании, каждая из которых обладает потенциалом для создания нескольких продуктов, трансформирующих здравоохранение человека или устойчивое развитие. С момента своего основания в 2000 году Flagship основала и развила более 100 научных предприятий, что привело к совокупной стоимости более 90 миллиардов долларов. Многие из компаний, основанных Flagship, решали самые насущные проблемы человечества: вакцинация миллиардов людей против COVID-19, лечение неизлечимых болезней, улучшение здоровья человека, предотвращение заболеваний и обеспечение продовольствием мира путем повышения устойчивости и экологичности сельского хозяйства. Flagship дважды была отмечена в списке "Change the World" журнала FORTUNE, ежегодном рейтинге компаний, оказавших положительное социальное и экологическое воздействие посредством деятельности, являющейся частью их основной бизнес-стратегии, и дважды была названа Fast Company одной из самых инновационных компаний мира. Узнайте больше о Flagship на Flagship Pioneering.

Flagship Pioneering и компании нашей экосистемы привержены принципу равных возможностей трудоустройства независимо от расы, цвета кожи, происхождения, религии, пола, национальности, сексуальной ориентации, возраста, гражданства, семейного положения, инвалидности, гендерной идентичности или статуса ветерана.

В Flagship мы понимаем, что идеального кандидата не существует. Если у вас есть часть перечисленного выше опыта, но не весь, пожалуйста, все равно подавайте заявку. Опыт бывает разным, навыки можно передавать, а энтузиазм имеет большое значение. Мы стремимся создавать разнообразные и инклюзивные команды и с нетерпением ждем возможности узнать больше о вашем уникальном опыте.

Рекрутинговые и кадровые агентства:

Flagship Pioneering и аффилированные с ней компании Flagship Lab (совместно именуемые "FSP") не принимают незапрошенные резюме ни от одного источника, кроме кандидатов. Предоставление незапрошенных резюме рекрутинговыми или кадровыми агентствами FSP или ее сотрудникам строго запрещено, если только они не были напрямую связаны с внутренней командой привлечения талантов Flagship Pioneering. Любое резюме, представленное агентством в отсутствие подписанного соглашения, автоматически становится собственностью FSP, и FSP не будет выплачивать никаких реферальных или иных вознаграждений в отношении него.

Уведомление о конфиденциальности для соискателей:

Когда вы подаете заявку на вакансию в Flagship Pioneering или одной из компаний портфеля, мы собираем и используем предоставленную вами личную информацию (такую как ваше имя, контактные данные, история работы и материалы заявки) для оценки вашей заявки, общения с вами и соблюдения юридических обязательств. Данные вашей заявки обрабатываются через Greenhouse, нашу систему отслеживания кандидатов, а также могут быть просмотрены с использованием инструментов ИИ-ассистированного скрининга. Мы не продаем вашу личную информацию. Жители Калифорнии имеют права в соответствии с CCPA/CPRA, включая право знать, удалять и отказаться от продажи своей личной информации. Если вы находитесь в ЕС или Великобритании, мы обрабатываем ваши данные в соответствии с GDPR, и вы имеете право на доступ, исправление и удаление ваших данных. Чтобы воспользоваться своими правами или задать вопросы, свяжитесь с контакт рекрутера.

Диапазон заработной платы для этой должности составляет 165 000–209 000 долларов США. Компенсация за должность будет зависеть от ряда факторов, включая квалификацию, навыки, компетенции и опыт кандидата. Expedition Medicines в настоящее время предлагает медицинское страхование, ежегодную программу стимулирования, пенсионные пособия и широкий спектр других льгот. Информация о компенсации и льготах основана на добросовестной оценке Expedition Medicines на дату публикации и может быть изменена в будущем.