О Apheris
В Apheris мы создаем будущее применения ИИ в фармацевтических НИОКР. Мы помогаем ведущим фармацевтическим командам быстрее находить и разрабатывать лекарства. Мы управляем крупнейшими в отрасли федеративными сетями данных для ИИ в области открытия лекарств, охватывающими совместное сворачивание, ADMET и определяемость антител.
В рамках этих сетей модели обучаются на проприетарных отраслевых наборах данных для достижения более высокой производительности и более широкой применимости, сохраняя при этом контроль над данными и защиту интеллектуальной собственности. Мы предоставляем эти превосходные модели через приложения для открытия лекарств, которые позволяют командам использовать их в масштабе, настраивать их дальше и интегрировать в существующие рабочие процессы НИОКР.
- Сеть ИИ структурной биологии (AISB): 20 ведущих фармацевтических компаний сотрудничают в области совместного сворачивания, прогнозирования сродства связывания на основе структуры и дизайна антител.
- Сеть ADMET: 50 ведущих фармацевтических компаний и биотехнологических компаний сотрудничают для улучшения прогнозирования свойств малых молекул и расширения на другие лекарственные формы.
- Сеть определяемости антител: Фармацевтические партнеры сотрудничают для федерализации исторических и специально созданных наборов данных определяемости антител для безопасного обучения ML, без передачи данных из среды каждого партнера.
О роли
Мы ищем специалиста по крупным молекулам, который принесет глубокие знания в области инженерии антител, структурной биологии и биопрепаратов в наши сети. Вы поможете определить научные рабочие процессы и стратегию моделирования для совместного сворачивания антител-антигенов, прогнозирования связующих веществ и прогнозирования определяемости, тесно сотрудничая с нашей командой ML и инженеров, которые занимаются фактическим созданием моделей.
Нам нужен этот человек, чтобы придать крупным молекулам реальную точку ответственности в Apheris: кто-то, кто будет решать, что является научно значимым по мере роста сети, и кто сможет говорить с партнерами с подлинным авторитетом в области открытия лекарств, а не только с авторитетом в области ИИ.
Вам не нужно писать код обучения или создавать модели самостоятельно. Вам нужна достаточная осведомленность об ИИ/ML, чтобы иметь реальное, информированное мнение о том, что создается: проверка результатов на разумность, выявление случаев, когда подход к моделированию не отражает биологическую реальность, и помощь в переводе научных вопросов в рабочий план.
Что вы будете делать
- Определять научный рабочий процесс, стратегию оценки и подход к бенчмаркингу для наших программ по крупным молекулам, включая совместное сворачивание антител-антигенов, прогнозирование связующих веществ и определяемость антител
- Использовать наш собственный продукт в качестве практического пользователя и определять требования пользователя к рабочим процессам для крупных молекул, чтобы создаваемое соответствовало тому, как работают ученые
- Стимулировать внедрение наших моделей для крупных молекул у фармацевтических партнеров, помогая им определить, к каким программам и вариантам использования их следует применять, и поддерживая их в получении реальной ценности от них
- Переводить научные и биологические требования от фармацевтических партнеров в конкретные входные данные, которые команда ML/инженеров сможет использовать для создания
- Анализировать выходные данные моделей и результаты оценки с учетом реальных знаний в области структурной биологии/инженерии антител, отмечая, что биологически не выдерживает критики
- Представлять научную точку зрения Apheris в беседах с партнерами в наших сетях по крупным молекулам, согласовывая цели, критерии оценки и требования к данным
- Оставаться в курсе событий в области ИИ/ML для крупных молекул (OpenFold, AlphaFold, Boltz, ESM, литература по дизайну/определяемости антител), чтобы иметь информированное мнение о подходе к моделированию
- Работать с продуктовой командой, командой ML и инженерами, чтобы гарантировать, что научные требования действительно формируют дорожную карту, а не просто добавляются в нее постфактум
Что мы ожидаем от вас
- У вас есть докторская степень, степень магистра или эквивалентный опыт, плюс 5+ лет в области структурной биологии, инженерии антител, иммунологии, инженерии белков или смежной дисциплины биопрепаратов
- У вас есть реальный практический опыт в дизайне антител, определении их применимости или открытии связующих веществ — это роль, где на первом месте стоят знания в предметной области
- У вас есть некоторый опыт применения ИИ/ML к биологическим задачам — вам не нужно создавать модели самостоятельно, но вы понимаете их достаточно хорошо, чтобы вносить вклад в рабочий процесс моделирования и судить, имеют ли смысл выходные данные
- Вы комфортно работаете в тесном сотрудничестве с командами ML/инженеров и выступаете переводчиком между биологическими рассуждениями и технической реализацией
- Вы четко общаетесь как с научной и технической аудиторией, так и с заинтересованными сторонами фармацевтических партнеров
Приятно иметь
- Вы знакомы с OpenFold, AlphaFold, Boltz или аналогичными инструментами прогнозирования структуры
- У вас есть опыт работы с анализами определяемости антител, иммуногенностью или производством биопрепаратов
- Вы работали непосредственно с фармацевтическими партнерами или в консорциуме/исследовательском сотрудничестве
- У вас есть публикации в области структурной биологии, иммунологии или инженерии антител
Что мы предлагаем вам
- Конкурентоспособная заработная плата с опционами на акции на ранней стадии
- Удаленный формат работы с гибкостью в выборе места работы
- Поддержка благополучия: ресурсы для психического здоровья, бюджет на обустройство домашнего офиса, стипендия на коворкинг, бюджет на обучение
- Щедро предоставляемые выходные дни
- Факультативные дни в офисе в Берлине (штаб-квартира) или другом европейском месте (примерно 3 раза в год)
- Команда, ориентированная на результат, с опытом работы в ведущих организациях
